고등학생인 Shinichi Kudou는 이미 여러 어려운 사건을 해결한 뛰어난 탐정으로 유명함.
신이치는 수상쩍은 행동을 하고 있다고 생각하는 두 사람을 따르기로 했을 때, 자신도 모르게 끔찍한 불법 작전을 목격하게 됨. 그가 체포되었을 때, 남자들은 범죄 조직이 개발한 신약으로 그를 실험하기로 결정하고 그의 운명에 그를 버림.
신이치가 시련을 이겨낸 유일한 이유는 놀랍게도 몸이 7살짜리 아이와 같았기 때문임.
소꿉친구인 모리 란과 그녀의 아버지 사립 탐정 모리 코고로를 포함하여 모두가 자신을 다른 사람으로 착각하게 하여 그의 원래 IQ는 완벽하게 보존됨.
에도가와 코난은 일본에서 가장 유명한 추리 작가인 에도가와 란포와 아서 코난 도일의 영향을 받아 취한 별명임.
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